Агрономічне відділення є одним з провідних та найстарших відділень ВСП «Мукачівський фаховий коледж НУБіП України». Історія агрономічного відділення почалася з 2 січня 1946 року, коли було організовано відділення рільництва, плодоовочівництва та виноградарства. на базі Мукачівського сільськогосподарського технікуму. Наші перші випускники (агрономи-рільники, плодоовочівники), які отримали 28 серпня 1949 року дипломи молодших агрономів, стали шанованими у краї аграріями.
У 2012 році було ліцензовано спеціальність 193 «Геодезія та землеустрій», в 2017 році - спеціальність 203 «Садівництво та виноградарство» за освітнім ступенем «Бакалавр», в 2019 році - спеціальність 101 «Екологія».
Зараз агрономічне відділення займає одну із ключових ланок навчального закладу і налічує більше 300 студентів денної та заочної форм навчання. Зміст і терміни навчання за спеціальностями на відділенні визначено освітніми програмами та навчальними планами.